Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms