Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCINQ13939 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCINQ13939 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCINQ13939 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCINQ13939 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCINQ13939 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCINQ13939 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCINQ13939 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCINQ13939 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCINQ13939 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCINQ13939 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCINQ13939 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCINQ13939 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCINQ13939 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCINQ13939 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCINQ13939 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCINQ13939 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCINQ13939 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCINQ13939 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCINQ13939 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCINQ13939 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCINQ13939 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCINQ13939 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCINQ13939 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCINQ13939 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCINQ13939 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCINQ13939 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCINQ13939 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCINQ13939 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCINQ13939 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCINQ13939 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCINQ13939 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCINQ13939 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCINQ13939 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCINQ13939 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCINQ13939 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCINQ13939 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCINQ13939 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCINQ13939 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCINQ13939 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCINQ13939 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCINQ13939 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCINQ13939 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCINQ13939 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCINQ13939 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCINQ13939 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCINQ13939 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCINQ13939 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCINQ13939 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCINQ13939 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCINQ13939 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCINQ13939 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCINQ13939 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCINQ13939 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCINQ13939 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCINQ13939 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCINQ13939 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCINQ13939 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCINQ13939 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCINQ13939 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCINQ13939 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCINQ13939 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCINQ13939 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCINQ13939 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCINQ13939 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCINQ13939 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCINQ13939 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCINQ13939 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCINQ13939 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCINQ13939 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCINQ13939 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCINQ13939 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCINQ13939 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCINQ13939 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCINQ13939 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCINQ13939 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCINQ13939 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCINQ13939 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCINQ13939 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCINQ13939 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCINQ13939 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCINQ13939 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCINQ13939 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCINQ13939 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCINQ13939 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCINQ13939 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCINQ13939 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCINQ13939 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCINQ13939 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCINQ13939 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCINQ13939 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCINQ13939 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCINQ13939 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCINQ13939 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCINQ13939 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCINQ13939 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCINQ13939 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCINQ13939 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCINQ13939 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCINQ13939 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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