Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX3Q13761 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms