Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCIRG1Q13488 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCIRG1Q13488 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
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