Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
XRCC4Q13426 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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