Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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