Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
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