Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRDNQ13061 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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