Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIN2AQ12879 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
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