Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PUDPQ08623 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms