Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms