Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CXCL9Q07325 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms