Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms