Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIN1Q05586 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms