Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLC6A3Q01959 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms