Protein–RNA interactions for Protein: Q00796

SORD, Sorbitol dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORDQ00796 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORDQ00796 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORDQ00796 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORDQ00796 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORDQ00796 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORDQ00796 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORDQ00796 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORDQ00796 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORDQ00796 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORDQ00796 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORDQ00796 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORDQ00796 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SORDQ00796 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SORDQ00796 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORDQ00796 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORDQ00796 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORDQ00796 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORDQ00796 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORDQ00796 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORDQ00796 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORDQ00796 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SORDQ00796 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SORDQ00796 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SORDQ00796 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SORDQ00796 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SORDQ00796 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SORDQ00796 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SORDQ00796 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SORDQ00796 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SORDQ00796 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SORDQ00796 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SORDQ00796 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SORDQ00796 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SORDQ00796 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SORDQ00796 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SORDQ00796 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SORDQ00796 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SORDQ00796 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SORDQ00796 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SORDQ00796 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SORDQ00796 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SORDQ00796 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SORDQ00796 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SORDQ00796 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SORDQ00796 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SORDQ00796 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SORDQ00796 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SORDQ00796 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SORDQ00796 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SORDQ00796 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SORDQ00796 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SORDQ00796 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SORDQ00796 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SORDQ00796 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms