Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK5Q00535 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms