Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2C1P98194 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms