Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD1P98174 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD1P98174 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD1P98174 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD1P98174 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD1P98174 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD1P98174 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD1P98174 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD1P98174 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD1P98174 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD1P98174 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD1P98174 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD1P98174 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD1P98174 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD1P98174 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD1P98174 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD1P98174 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD1P98174 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD1P98174 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD1P98174 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD1P98174 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD1P98174 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD1P98174 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD1P98174 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD1P98174 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD1P98174 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD1P98174 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD1P98174 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD1P98174 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGD1P98174 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD1P98174 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD1P98174 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD1P98174 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD1P98174 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD1P98174 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD1P98174 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD1P98174 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD1P98174 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD1P98174 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD1P98174 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD1P98174 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD1P98174 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD1P98174 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD1P98174 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD1P98174 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD1P98174 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD1P98174 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD1P98174 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD1P98174 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD1P98174 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD1P98174 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD1P98174 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD1P98174 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD1P98174 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD1P98174 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD1P98174 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD1P98174 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD1P98174 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD1P98174 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD1P98174 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD1P98174 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD1P98174 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD1P98174 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGD1P98174 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD1P98174 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD1P98174 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD1P98174 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD1P98174 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD1P98174 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD1P98174 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD1P98174 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD1P98174 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD1P98174 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD1P98174 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD1P98174 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD1P98174 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD1P98174 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD1P98174 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD1P98174 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD1P98174 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD1P98174 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD1P98174 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD1P98174 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD1P98174 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD1P98174 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD1P98174 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD1P98174 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD1P98174 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD1P98174 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD1P98174 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD1P98174 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD1P98174 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD1P98174 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD1P98174 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD1P98174 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD1P98174 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGD1P98174 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGD1P98174 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms