Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNB1P98172 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms