Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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TMEM258P61165 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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TMEM258P61165 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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TMEM258P61165 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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TMEM258P61165 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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TMEM258P61165 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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TMEM258P61165 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TMEM258P61165 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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