Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA6P60900 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms