Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP107P57740 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP107P57740 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP107P57740 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP107P57740 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP107P57740 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP107P57740 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP107P57740 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP107P57740 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP107P57740 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP107P57740 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP107P57740 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP107P57740 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP107P57740 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP107P57740 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP107P57740 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP107P57740 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP107P57740 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP107P57740 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP107P57740 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP107P57740 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP107P57740 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP107P57740 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP107P57740 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP107P57740 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP107P57740 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP107P57740 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP107P57740 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP107P57740 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP107P57740 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP107P57740 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms