Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms