Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFDNP55196 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFDNP55196 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFDNP55196 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFDNP55196 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFDNP55196 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFDNP55196 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFDNP55196 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFDNP55196 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFDNP55196 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AFDNP55196 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFDNP55196 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFDNP55196 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFDNP55196 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFDNP55196 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFDNP55196 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AFDNP55196 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFDNP55196 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFDNP55196 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFDNP55196 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFDNP55196 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFDNP55196 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AFDNP55196 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFDNP55196 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFDNP55196 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFDNP55196 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFDNP55196 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFDNP55196 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFDNP55196 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFDNP55196 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFDNP55196 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AFDNP55196 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AFDNP55196 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFDNP55196 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFDNP55196 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFDNP55196 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFDNP55196 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFDNP55196 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFDNP55196 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFDNP55196 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFDNP55196 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFDNP55196 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFDNP55196 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFDNP55196 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFDNP55196 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFDNP55196 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFDNP55196 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AFDNP55196 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFDNP55196 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFDNP55196 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AFDNP55196 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AFDNP55196 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
AFDNP55196 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
AFDNP55196 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFDNP55196 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFDNP55196 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFDNP55196 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFDNP55196 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AFDNP55196 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFDNP55196 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFDNP55196 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFDNP55196 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFDNP55196 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFDNP55196 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFDNP55196 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFDNP55196 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFDNP55196 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFDNP55196 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFDNP55196 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFDNP55196 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFDNP55196 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFDNP55196 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFDNP55196 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AFDNP55196 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFDNP55196 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFDNP55196 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFDNP55196 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AFDNP55196 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFDNP55196 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFDNP55196 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFDNP55196 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFDNP55196 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFDNP55196 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFDNP55196 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFDNP55196 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFDNP55196 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFDNP55196 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AFDNP55196 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFDNP55196 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFDNP55196 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFDNP55196 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFDNP55196 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFDNP55196 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFDNP55196 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AFDNP55196 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFDNP55196 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFDNP55196 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AFDNP55196 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFDNP55196 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFDNP55196 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms