Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms