Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRPC1P48995 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRPC1P48995 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRPC1P48995 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRPC1P48995 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRPC1P48995 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRPC1P48995 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRPC1P48995 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRPC1P48995 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRPC1P48995 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRPC1P48995 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRPC1P48995 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRPC1P48995 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRPC1P48995 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRPC1P48995 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRPC1P48995 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRPC1P48995 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRPC1P48995 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRPC1P48995 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRPC1P48995 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRPC1P48995 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRPC1P48995 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRPC1P48995 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRPC1P48995 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRPC1P48995 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRPC1P48995 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms