Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRT6CP48668 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms