Protein–RNA interactions for Protein: P48147

PREP, Prolyl endopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREPP48147 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PREPP48147 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PREPP48147 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PREPP48147 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PREPP48147 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PREPP48147 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PREPP48147 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PREPP48147 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PREPP48147 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PREPP48147 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PREPP48147 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PREPP48147 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PREPP48147 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PREPP48147 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PREPP48147 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PREPP48147 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PREPP48147 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PREPP48147 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PREPP48147 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PREPP48147 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms