Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5OP48047 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms