Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRATP43155 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRATP43155 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRATP43155 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRATP43155 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRATP43155 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRATP43155 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRATP43155 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRATP43155 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRATP43155 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRATP43155 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRATP43155 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRATP43155 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRATP43155 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRATP43155 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRATP43155 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRATP43155 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CRATP43155 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CRATP43155 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRATP43155 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CRATP43155 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CRATP43155 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRATP43155 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRATP43155 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CRATP43155 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRATP43155 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRATP43155 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRATP43155 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRATP43155 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRATP43155 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRATP43155 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRATP43155 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRATP43155 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRATP43155 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRATP43155 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRATP43155 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CRATP43155 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CRATP43155 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CRATP43155 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CRATP43155 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRATP43155 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRATP43155 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRATP43155 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRATP43155 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRATP43155 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRATP43155 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRATP43155 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRATP43155 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRATP43155 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRATP43155 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRATP43155 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CRATP43155 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRATP43155 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRATP43155 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRATP43155 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CRATP43155 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CRATP43155 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRATP43155 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRATP43155 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRATP43155 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRATP43155 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms