Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDH1P40925 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDH1P40925 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDH1P40925 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDH1P40925 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MDH1P40925 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDH1P40925 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDH1P40925 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDH1P40925 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDH1P40925 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDH1P40925 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDH1P40925 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDH1P40925 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDH1P40925 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDH1P40925 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDH1P40925 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDH1P40925 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDH1P40925 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDH1P40925 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MDH1P40925 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDH1P40925 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MDH1P40925 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDH1P40925 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDH1P40925 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDH1P40925 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDH1P40925 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDH1P40925 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDH1P40925 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDH1P40925 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDH1P40925 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MDH1P40925 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDH1P40925 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDH1P40925 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDH1P40925 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDH1P40925 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDH1P40925 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDH1P40925 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDH1P40925 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDH1P40925 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDH1P40925 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDH1P40925 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDH1P40925 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDH1P40925 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDH1P40925 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDH1P40925 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDH1P40925 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDH1P40925 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDH1P40925 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDH1P40925 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDH1P40925 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDH1P40925 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDH1P40925 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDH1P40925 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDH1P40925 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDH1P40925 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDH1P40925 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDH1P40925 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDH1P40925 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDH1P40925 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDH1P40925 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDH1P40925 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDH1P40925 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDH1P40925 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDH1P40925 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDH1P40925 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDH1P40925 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDH1P40925 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDH1P40925 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDH1P40925 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDH1P40925 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDH1P40925 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDH1P40925 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDH1P40925 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDH1P40925 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDH1P40925 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDH1P40925 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDH1P40925 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDH1P40925 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDH1P40925 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDH1P40925 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDH1P40925 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDH1P40925 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDH1P40925 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDH1P40925 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDH1P40925 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MDH1P40925 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDH1P40925 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDH1P40925 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDH1P40925 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDH1P40925 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDH1P40925 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDH1P40925 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDH1P40925 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDH1P40925 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDH1P40925 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDH1P40925 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDH1P40925 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDH1P40925 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDH1P40925 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDH1P40925 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms