Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TGFBR1P36897 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms