Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms