Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP214P35658 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP214P35658 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP214P35658 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP214P35658 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP214P35658 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP214P35658 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP214P35658 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP214P35658 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP214P35658 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP214P35658 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP214P35658 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP214P35658 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP214P35658 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP214P35658 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP214P35658 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP214P35658 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP214P35658 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NUP214P35658 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NUP214P35658 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NUP214P35658 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP214P35658 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP214P35658 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP214P35658 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP214P35658 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP214P35658 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP214P35658 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP214P35658 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP214P35658 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP214P35658 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP214P35658 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP214P35658 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP214P35658 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP214P35658 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP214P35658 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP214P35658 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP214P35658 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP214P35658 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP214P35658 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP214P35658 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP214P35658 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP214P35658 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP214P35658 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP214P35658 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP214P35658 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP214P35658 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP214P35658 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP214P35658 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP214P35658 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP214P35658 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP214P35658 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP214P35658 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP214P35658 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP214P35658 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP214P35658 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP214P35658 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP214P35658 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP214P35658 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP214P35658 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP214P35658 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP214P35658 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP214P35658 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP214P35658 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP214P35658 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms