Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP6P35125 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP6P35125 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP6P35125 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP6P35125 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP6P35125 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP6P35125 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP6P35125 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP6P35125 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP6P35125 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP6P35125 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP6P35125 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP6P35125 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USP6P35125 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USP6P35125 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP6P35125 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP6P35125 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP6P35125 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP6P35125 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USP6P35125 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP6P35125 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP6P35125 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP6P35125 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP6P35125 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP6P35125 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP6P35125 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP6P35125 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP6P35125 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP6P35125 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP6P35125 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP6P35125 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USP6P35125 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP6P35125 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP6P35125 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP6P35125 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP6P35125 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP6P35125 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP6P35125 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP6P35125 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP6P35125 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP6P35125 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP6P35125 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP6P35125 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP6P35125 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP6P35125 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
USP6P35125 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP6P35125 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP6P35125 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP6P35125 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP6P35125 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP6P35125 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP6P35125 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP6P35125 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP6P35125 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP6P35125 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP6P35125 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP6P35125 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP6P35125 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP6P35125 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP6P35125 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP6P35125 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP6P35125 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP6P35125 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP6P35125 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP6P35125 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP6P35125 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP6P35125 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP6P35125 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP6P35125 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP6P35125 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP6P35125 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP6P35125 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP6P35125 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP6P35125 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP6P35125 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP6P35125 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP6P35125 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP6P35125 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP6P35125 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP6P35125 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
USP6P35125 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP6P35125 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP6P35125 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP6P35125 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
USP6P35125 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP6P35125 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP6P35125 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP6P35125 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP6P35125 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP6P35125 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP6P35125 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP6P35125 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP6P35125 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP6P35125 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP6P35125 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP6P35125 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP6P35125 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP6P35125 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP6P35125 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP6P35125 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms