Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF4P34130 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF4P34130 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF4P34130 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF4P34130 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF4P34130 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF4P34130 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF4P34130 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF4P34130 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF4P34130 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF4P34130 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF4P34130 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF4P34130 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF4P34130 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF4P34130 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF4P34130 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF4P34130 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF4P34130 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NTF4P34130 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF4P34130 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF4P34130 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF4P34130 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF4P34130 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF4P34130 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF4P34130 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF4P34130 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF4P34130 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF4P34130 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF4P34130 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF4P34130 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF4P34130 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF4P34130 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF4P34130 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF4P34130 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF4P34130 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF4P34130 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF4P34130 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF4P34130 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF4P34130 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF4P34130 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF4P34130 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF4P34130 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF4P34130 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF4P34130 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF4P34130 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF4P34130 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF4P34130 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF4P34130 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF4P34130 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF4P34130 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NTF4P34130 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF4P34130 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF4P34130 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF4P34130 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF4P34130 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF4P34130 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF4P34130 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF4P34130 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF4P34130 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF4P34130 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF4P34130 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF4P34130 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF4P34130 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF4P34130 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NTF4P34130 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms