Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKARP32238 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKARP32238 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKARP32238 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKARP32238 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKARP32238 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKARP32238 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKARP32238 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKARP32238 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKARP32238 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKARP32238 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKARP32238 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKARP32238 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKARP32238 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKARP32238 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKARP32238 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKARP32238 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKARP32238 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKARP32238 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKARP32238 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKARP32238 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKARP32238 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKARP32238 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKARP32238 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKARP32238 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKARP32238 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKARP32238 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKARP32238 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKARP32238 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKARP32238 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKARP32238 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKARP32238 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKARP32238 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKARP32238 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCKARP32238 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCKARP32238 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCKARP32238 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCKARP32238 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCKARP32238 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCKARP32238 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCKARP32238 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCKARP32238 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCKARP32238 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCKARP32238 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCKARP32238 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCKARP32238 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCKARP32238 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCKARP32238 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCKARP32238 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCKARP32238 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCKARP32238 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCKARP32238 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCKARP32238 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCKARP32238 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCKARP32238 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCKARP32238 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCKARP32238 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCKARP32238 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCKARP32238 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCKARP32238 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCKARP32238 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCKARP32238 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCKARP32238 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCKARP32238 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCKARP32238 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCKARP32238 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms