Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TSPOP30536 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TSPOP30536 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TSPOP30536 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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