Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB2P29033 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB2P29033 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB2P29033 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB2P29033 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB2P29033 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB2P29033 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB2P29033 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB2P29033 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB2P29033 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB2P29033 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB2P29033 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB2P29033 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB2P29033 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB2P29033 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB2P29033 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB2P29033 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB2P29033 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB2P29033 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB2P29033 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB2P29033 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB2P29033 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB2P29033 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJB2P29033 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB2P29033 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB2P29033 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB2P29033 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB2P29033 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB2P29033 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB2P29033 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB2P29033 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB2P29033 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB2P29033 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB2P29033 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB2P29033 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB2P29033 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB2P29033 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB2P29033 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB2P29033 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB2P29033 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB2P29033 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB2P29033 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB2P29033 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB2P29033 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB2P29033 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB2P29033 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJB2P29033 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJB2P29033 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB2P29033 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB2P29033 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB2P29033 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB2P29033 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB2P29033 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB2P29033 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB2P29033 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB2P29033 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB2P29033 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB2P29033 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB2P29033 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB2P29033 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB2P29033 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJB2P29033 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms