Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX2P28328 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX2P28328 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX2P28328 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX2P28328 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX2P28328 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX2P28328 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX2P28328 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX2P28328 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX2P28328 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX2P28328 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX2P28328 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX2P28328 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX2P28328 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX2P28328 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX2P28328 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX2P28328 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX2P28328 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX2P28328 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX2P28328 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX2P28328 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX2P28328 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX2P28328 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX2P28328 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX2P28328 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PEX2P28328 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PEX2P28328 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PEX2P28328 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PEX2P28328 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PEX2P28328 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PEX2P28328 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PEX2P28328 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PEX2P28328 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PEX2P28328 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PEX2P28328 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PEX2P28328 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX2P28328 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX2P28328 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX2P28328 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX2P28328 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX2P28328 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX2P28328 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX2P28328 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX2P28328 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX2P28328 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX2P28328 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX2P28328 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX2P28328 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX2P28328 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX2P28328 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX2P28328 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX2P28328 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX2P28328 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX2P28328 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX2P28328 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX2P28328 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX2P28328 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX2P28328 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX2P28328 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX2P28328 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX2P28328 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PEX2P28328 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms