Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTX3P26022 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTX3P26022 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTX3P26022 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTX3P26022 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTX3P26022 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTX3P26022 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTX3P26022 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTX3P26022 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTX3P26022 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTX3P26022 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTX3P26022 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTX3P26022 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTX3P26022 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTX3P26022 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTX3P26022 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTX3P26022 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTX3P26022 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTX3P26022 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTX3P26022 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTX3P26022 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTX3P26022 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTX3P26022 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTX3P26022 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTX3P26022 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTX3P26022 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTX3P26022 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTX3P26022 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTX3P26022 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTX3P26022 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTX3P26022 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTX3P26022 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTX3P26022 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTX3P26022 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTX3P26022 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTX3P26022 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTX3P26022 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTX3P26022 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTX3P26022 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTX3P26022 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTX3P26022 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTX3P26022 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTX3P26022 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTX3P26022 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTX3P26022 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTX3P26022 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTX3P26022 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTX3P26022 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTX3P26022 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTX3P26022 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTX3P26022 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTX3P26022 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTX3P26022 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTX3P26022 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTX3P26022 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTX3P26022 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTX3P26022 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTX3P26022 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTX3P26022 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTX3P26022 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTX3P26022 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTX3P26022 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTX3P26022 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTX3P26022 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTX3P26022 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTX3P26022 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTX3P26022 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms