Protein–RNA interactions for Protein: P23919

DTYMK, Thymidylate kinase, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTYMKP23919 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DTYMKP23919 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms