Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPREP23469 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPREP23469 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPREP23469 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPREP23469 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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PTPREP23469 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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PTPREP23469 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPREP23469 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPREP23469 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPREP23469 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPREP23469 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPREP23469 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPREP23469 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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PTPREP23469 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPREP23469 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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PTPREP23469 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPREP23469 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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PTPREP23469 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPREP23469 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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PTPREP23469 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPREP23469 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPREP23469 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPREP23469 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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PTPREP23469 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPREP23469 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPREP23469 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPREP23469 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPREP23469 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPREP23469 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPREP23469 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPREP23469 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPREP23469 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPREP23469 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPREP23469 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPREP23469 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPREP23469 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPREP23469 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPREP23469 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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