Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

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Length 2,839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NF1P21359 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NF1P21359 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NF1P21359 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NF1P21359 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NF1P21359 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NF1P21359 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NF1P21359 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NF1P21359 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NF1P21359 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NF1P21359 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NF1P21359 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NF1P21359 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NF1P21359 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NF1P21359 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NF1P21359 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NF1P21359 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NF1P21359 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NF1P21359 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NF1P21359 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NF1P21359 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NF1P21359 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NF1P21359 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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NF1P21359 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NF1P21359 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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NF1P21359 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NF1P21359 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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NF1P21359 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NF1P21359 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NF1P21359 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NF1P21359 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NF1P21359 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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NF1P21359 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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NF1P21359 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NF1P21359 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NF1P21359 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NF1P21359 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NF1P21359 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NF1P21359 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NF1P21359 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NF1P21359 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NF1P21359 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NF1P21359 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NF1P21359 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NF1P21359 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NF1P21359 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NF1P21359 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NF1P21359 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NF1P21359 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NF1P21359 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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