Protein–RNA interactions for Protein: P16871

IL7R, Interleukin-7 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL7RP16871 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL7RP16871 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL7RP16871 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL7RP16871 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL7RP16871 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL7RP16871 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL7RP16871 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL7RP16871 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL7RP16871 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL7RP16871 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL7RP16871 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL7RP16871 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL7RP16871 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL7RP16871 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IL7RP16871 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL7RP16871 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL7RP16871 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL7RP16871 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL7RP16871 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL7RP16871 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL7RP16871 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL7RP16871 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL7RP16871 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL7RP16871 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL7RP16871 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL7RP16871 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL7RP16871 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL7RP16871 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL7RP16871 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL7RP16871 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL7RP16871 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL7RP16871 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL7RP16871 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL7RP16871 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL7RP16871 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL7RP16871 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IL7RP16871 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL7RP16871 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL7RP16871 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL7RP16871 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL7RP16871 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL7RP16871 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IL7RP16871 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL7RP16871 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL7RP16871 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IL7RP16871 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL7RP16871 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL7RP16871 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL7RP16871 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL7RP16871 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL7RP16871 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL7RP16871 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL7RP16871 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL7RP16871 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL7RP16871 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL7RP16871 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IL7RP16871 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL7RP16871 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL7RP16871 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL7RP16871 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL7RP16871 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL7RP16871 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IL7RP16871 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL7RP16871 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL7RP16871 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL7RP16871 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IL7RP16871 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL7RP16871 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL7RP16871 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL7RP16871 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL7RP16871 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL7RP16871 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL7RP16871 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL7RP16871 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL7RP16871 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL7RP16871 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL7RP16871 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL7RP16871 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL7RP16871 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IL7RP16871 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL7RP16871 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL7RP16871 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL7RP16871 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL7RP16871 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL7RP16871 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL7RP16871 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL7RP16871 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL7RP16871 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL7RP16871 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IL7RP16871 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL7RP16871 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL7RP16871 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL7RP16871 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL7RP16871 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL7RP16871 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IL7RP16871 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL7RP16871 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL7RP16871 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL7RP16871 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IL7RP16871 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms