Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT3P12035 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT3P12035 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT3P12035 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT3P12035 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT3P12035 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT3P12035 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT3P12035 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT3P12035 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT3P12035 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT3P12035 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT3P12035 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT3P12035 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT3P12035 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT3P12035 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT3P12035 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT3P12035 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT3P12035 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT3P12035 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT3P12035 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT3P12035 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT3P12035 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT3P12035 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT3P12035 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT3P12035 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KRT3P12035 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KRT3P12035 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KRT3P12035 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KRT3P12035 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KRT3P12035 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KRT3P12035 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KRT3P12035 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KRT3P12035 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT3P12035 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT3P12035 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT3P12035 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT3P12035 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT3P12035 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT3P12035 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT3P12035 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT3P12035 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT3P12035 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT3P12035 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT3P12035 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT3P12035 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT3P12035 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT3P12035 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT3P12035 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT3P12035 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT3P12035 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT3P12035 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT3P12035 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT3P12035 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT3P12035 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT3P12035 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT3P12035 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT3P12035 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT3P12035 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT3P12035 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT3P12035 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT3P12035 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT3P12035 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT3P12035 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT3P12035 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT3P12035 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT3P12035 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT3P12035 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT3P12035 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT3P12035 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT3P12035 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT3P12035 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT3P12035 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT3P12035 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT3P12035 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT3P12035 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT3P12035 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT3P12035 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT3P12035 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT3P12035 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT3P12035 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT3P12035 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT3P12035 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT3P12035 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT3P12035 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT3P12035 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT3P12035 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT3P12035 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT3P12035 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT3P12035 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT3P12035 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT3P12035 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT3P12035 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT3P12035 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT3P12035 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT3P12035 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT3P12035 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT3P12035 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT3P12035 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT3P12035 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT3P12035 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.8 ms