Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMC1P11047 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMC1P11047 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms