Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD8BP10966 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD8BP10966 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CD8BP10966 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CD8BP10966 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CD8BP10966 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD8BP10966 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD8BP10966 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD8BP10966 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD8BP10966 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD8BP10966 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD8BP10966 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD8BP10966 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD8BP10966 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD8BP10966 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD8BP10966 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD8BP10966 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD8BP10966 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD8BP10966 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD8BP10966 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD8BP10966 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD8BP10966 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD8BP10966 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD8BP10966 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD8BP10966 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD8BP10966 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD8BP10966 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD8BP10966 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD8BP10966 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD8BP10966 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD8BP10966 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD8BP10966 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD8BP10966 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD8BP10966 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD8BP10966 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD8BP10966 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8BP10966 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8BP10966 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8BP10966 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8BP10966 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8BP10966 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8BP10966 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8BP10966 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8BP10966 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8BP10966 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8BP10966 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8BP10966 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8BP10966 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8BP10966 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8BP10966 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8BP10966 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8BP10966 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8BP10966 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8BP10966 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8BP10966 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8BP10966 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8BP10966 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8BP10966 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8BP10966 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8BP10966 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8BP10966 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8BP10966 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8BP10966 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD8BP10966 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD8BP10966 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms