Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RGPD2P0DJD1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGPD2P0DJD1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms